皇家事务部是合并了皇宫内部一些机构，并整合了太常寺、宗正寺、光禄寺、鸿胪寺的诸多功能，专门负责皇家事务的部门，主要有皇家祭祀、宗室族谱编修、宗室子弟的培养、教育、婚姻等皇家事务，权利可是不小。我把第一任皇家事务大臣的位置给当年因“庆元党禁”冤死的赵汝愚的孙子赵崇惠，并把赵汝愚死后追封的福王封号也一并给他。他可是我叔叔辈的人物。而且他老子和史弥远不对付，一直被史弥远压得抬不起头。如今我把他扶了起来，自然对我感激涕淋。但我也个他找了个小麻烦，把杨谷、杨石两兄弟安排到皇家事务部做他的副手。这样，既能让他们互相监视，也讨好了杨太后。果然，得到消息的杨太后非常高兴，对改制极度支持，两兄弟更是感恩戴德。他们三个虽然没什么才干，但皇家事务大多有严格规制，又有原来太常寺、宗正寺、光禄寺、鸿胪寺一干得力官员协助，出不了什么岔子。
医药部从原来太医局升格而成，主要负责完善全国医疗、防疫体系，培养、训练各种医药人才，建立、完善各医药人员的培养、训练机制。医药大臣是原太医院主事章霈冉。
法务部是执法单位，负责各地治安及各类案件的侦办、审理工作，邓若水成为第一任的法务大臣，他手里名义上还是治安军的最高指挥官，实际上治安军基本由各地地方长官直接掌管，治安军只配备冷兵器，只有少量人员能装备火枪，他们一般不直接参加战争，除非国家沦陷，全民参战。功能类似后世的警察。法务部另一个功能如同高级法院，地方长官在案件审理之后，要上报法务部，法务部批复后即可结案，如有疑问则打回重审，或交给法务部直属刑侦局进行重新侦察，首任刑侦局长就是大名鼎鼎的宋慈，他上任后立即赴各地抽查各类案件，查察冤狱。
内务部是针对内部安定的部门，手里掌握各路警备军的调动、指挥权利，维持国内安定团结的大好局面，说白了就是镇压反叛。警备军从国防军中剥离出来，原则上不参加国家间的战争，如果战争需要，须经大臣议会批准，才能将其划入国防部的战斗序列。而平时内务部对警备军也没有调动的权利，只有经大臣议会授权才能调动。他下属还有一个调查单位―国家事务统计局，不用我说大家也知道这个单位是干什么的。这么紧要的部门当然非亲信莫属，荣王自是理想人选。
国防部前身就是兵部，只是把警备军的管辖权剥离，但把军校划入其管辖范围，其他没变，任务为国土防御和扩张（目前只能说是收复失地），战时国防部可以调动师以下单位，师以上的调动权在大臣议会，皇家近卫军只有皇帝可以调动。
还有个专业直属部门被保留了下来，就是钦天监，原来叫太史局，现在被独立出来，专门负责制定历法，天气、星象研究。设备和人员得到大幅改进和补充。我决定在明年改元，然后实施根据《十二气历》和《统天历》重新编修的历法，只保留原来的二十四节气部分。宁宗时，杨忠辅主持修成的《统天历》所测定的回归年长度为365.2425日，这和后世的日历完全一致。钦天监总监是宗亮的老丈人孙辅正，这也是个多年郁郁不得志的牛人，以后会提到。
全国十六个行政区块由原来的路改为省，省以下分别为府、州、县、市（三千户以下）、乡（二千户以下）、镇（一千户以下）、村（五百户以下）、里（二百户以下），保（不足一百户），临安府为直隶府，级别与省相同。各省最高主官为省长，各省依照当地情况按各部要求配备相应的省局，在省政府管理下治理地方事务，如财政局、教育局、工贸局等。政府税收不再收取金属货币，只收取宝钞，各省银行负责各类货币及资金与中央银行进行汇兑，避免因金属货币的火耗加重民间负担。各省的警备军由内务部直接指挥，治安军由省政府设立治安局管辖。
省以下的府、州、县均按以上配置，市以下的按当地实际情况予以简化。里以下只设里长全面负责，里、保长由当地居民直接选出，无特殊情况政府不直接任命，也无任期制度，优秀者政府将酌情提升。
另外对封爵体制也进行了简化，设立了王、公、侯、伯、子、男、爵士六等爵位，被封爵就意味着成为所谓的贵族，才有资格进入贵族议会，只有大臣议会才能授予他人爵位。王爵则被取消，已经封王的不受影响。后来由于沈发功劳极大，而且沈家一直以来忠心耿耿，我破例给了他王的爵位，以表彰他们一家。所有爵位只能世袭一代，而且还要降一级，后代自己有功勋的除外。
军队中一般用勋章表彰其获得的功绩和荣誉，设帝国金龙勋章、帝国银龙勋章、帝国金炙勋章、帝国银质勋章、帝国金龙奖章、帝国金质奖章六级。后来还有一些因当时特殊情况设立的勋章，比如灭了金国后的光复勋章、将蒙古赶回漠北并征服吐蕃各部后的解放勋章等。
官员品级依然保留原来正、从一到九品这样的十八级。而学术和技术等级则按学科加以区分，文科、医科、农科设学生、秀才（乡试通过）、太学生（会试通过进入太学的）、进士（殿试通过）、学士（有学术文章发表者）、博士（有特殊学术地位和权威者）。工科则设学徒、技工（乡试通过）、技师（会试通过）、高级技师（殿试通过）、工程师（有学术文章发表者）、高级工程师（有特殊发明和特殊技术贡献者）。
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