江南反抗迭起
忽必烈频繁发动对外战争，使无数的汉人将士死于海外战场，有人说这是忽必烈在借刀杀人。不管这种说法是否准确，但江南民众不服蒙古人的统治，反抗此起彼伏，却是真的。
由于南宋朝廷腐败，忽必烈只用数年时间，就灭掉了南宋。可是，灭掉一个政权容易，要想收服民心，可就难了。南方民众在宋朝统治下生活了三百多年，正统观念根深蒂固，对夷族统治有着很强的抵触情绪；南方经济发达，儒学盛行，对北方的粗犷文化和习惯难以接受；南方与北方在社会结构、经济发展、文明程度、道德伦理、生活习惯等各个方面，都存在着很大的差异。因此，在江南民众的心里，并不服从元朝的统治，绝大多数士大夫们，都采取了不与元朝合作的态度。
在这种情况下，忽必烈没有采取积极的安抚措施，反而对南方实行提防和歧视政策，把南人视为最低一等人群，给予不公平待遇；江南富裕，元朝就加重税赋，大肆掠夺江南财富，搞得南方民不聊生；忽必烈对海外用兵，需要大量水手，就在江南水乡强行征召，民众不堪重负。忽必烈的政策失误，加重了江南民众负担，加剧了矛盾，更加激发了江南民众的反抗情绪。因此，江南反抗迭起，给元朝的统治造成很大冲击。
公元1280年，在南宋灭亡的第二年，福建漳州农民陈钓眼就聚众起义，反抗元朝。陈钓眼个性刚烈，胆大气豪，曾经参加文天祥的军队，与元军作战。陈钓眼义旗一举，很快聚集五万多人，攻占了漳州城，自称为“镇闽开国大王”。
元朝朝廷震惊，派元军镇压。起义军敌不过如狠似虎的蒙古铁骑，浴血奋战一年之后，全军覆没，陈钓眼被杀。
公元1283年，原南宋官员林桂芳在广东组织起义，大批民众参加。起义军活动在广东新会一带，建立了罗平国，称年号为延康。后来，起义军被元军镇压，林桂芳牺牲。
同一年，南宋降将黄华在福建起兵反元。黄华原是南宋将领，归降了元朝，被授予建宁路管军总管职务。他看到江南民众深受元朝之害，特别是大批降元的将士死于海外战场，十分愤慨，毅然举兵造反，公开打出了恢复宋朝的旗号。
黄华有勇有谋，队伍发展到十几万人，攻占浦城、崇安等地，势力扩大到江西、浙江一带，威震东南半壁江山。
朝廷大为惊恐，急忙调集四个省的蒙古兵进行围剿。黄华率军退入山区，坚持斗争五年之久，最终兵败，黄华自焚。
公元1284年，广东人欧南喜聚众十万，起兵反元，攻城略地，声势浩大。元朝派兵镇压，却被起义军打败，生擒元将合剌普华。后来，起义军攻打广州失利，部队溃散，欧南喜被杀。
公元1287年，钟明亮在福建汀州举行起义，很快聚集十万多人。元朝派大批军队围攻，钟明亮采取流动作战的方式，不与元军硬碰，而是打游击战，活跃于福建、江西、广东三省边界地区。元军围追堵截，疲于奔命，却始终不能消灭起义军，直到两年后，钟明亮病逝，起义才被平息。