康熙皇帝继续南下，经无锡、苏州到达杭州。大臣们认为，杭州以南没有大城市了，可以返回。不料，康熙坚持再往南走，要去绍兴。
康熙去绍兴是有目的的，他要去祭祀大禹陵。大禹是汉人祖先之一，在汉人中有着崇高威望。康熙到了大禹陵前，抛开皇帝身份，跪倒在地，行三跪九叩大礼。此举打动了不少汉人的心。
拜完了大禹陵，康熙皇帝才开始回返，路过曲阜时，又去拜谒孔子庙，依然行三跪九叩大礼，并亲手书写“万世师表”四个大字。直到今天，这个牌匾还在孔庙高高悬挂着。同时，康熙令皇弟常宁祭拜周公庙，并下令免除曲阜县一年的税赋。许多知识分子和民众受到感动，被康熙皇帝的举动所折服。
康熙皇帝第一次南巡，历时数月，到过许多地方，办了不少大事，效果十分明显。康熙在南巡之中，仍然心系政务，令将军国大事每三天向他呈报一次。康熙白天举行各种活动，晚上处理政务，常常忙到深夜，十分辛苦。
公元1689年，康熙皇帝第二次巡视江南。康熙对第一次南巡很满意，决定再接再厉，进一步扩大成果。所以，这次南巡与上次的目的差不多，往返路程也大体相同。
康熙皇帝第二次参观趵突泉，写“作霖”二字，又登上泰山，拨款修葺泰山神庙宇。康熙到了南京，第二次祭拜朱元璋陵墓，然后再到绍兴祭祀大禹，亲自写了《禹陵颂》。
公元1699年至1705年，康熙皇帝又三次巡视江南。这几次除了继续宣扬皇恩、收服人心之外，增加了视察灾区、治理水患的内容。
当时，黄河、淮河等河流水患严重，康熙皇帝亲自到灾区察看，与当地官员研究治河方案。康熙先后到过临清、聊城、东平、济宁、盐城、宿迁、淮安、扬州等沿河地区，考察了漳河、永定河、小滹沱河、黄河、淮河等多条河流，提拔于成龙等一批贤臣担任治水官员。经过几年努力，水患得到有效治理。康熙皇帝通过为百姓办实事，赢得了民心。
公元1707年，康熙皇帝第六次巡视江南。这个时候，清朝入关已经六十多年，康熙亲政也已经四十年，天下太平，经济繁荣，百姓富裕，进入盛世。所以，康熙这次南巡，得到沿途百姓热烈欢迎。康熙皇帝一出北京，运河两岸就聚满了民众，足有数十万人。人们有的高呼万岁，有的跟随龙舟奔跑，有的跪地磕头，盛况空前。
康熙皇帝到了扬州，住进了行宫。扬州百姓再也不是从前的态度，而是扶老携幼，夹道欢迎，不少人献上珍贵物品。有个百姓献上了祖传的《炼丹养身秘书》，希望康熙皇帝能够长生不死。康熙不信这个，没有接受。康熙在扬州一连住了十天，遂了心愿。
康熙皇帝六下江南，对于收服民心、稳定政局成效显著。同时，他通过了解社情民意，掌握了宝贵的第一手资料，对于制定政策、治理国家也起到了重要作用。
康熙皇帝雄才大略，治理国家成效显著，可他对于治理家庭，尤其是对儿子们，却显得有点费劲，有些事情绞尽脑汁，不好处理。