回到皇宫以后，太监张殷哭拜在地，劝皇帝投降。崇祯皇帝大怒，将他一剑刺死。
崇祯皇帝有三个儿子、两个女儿。崇祯皇帝把太子朱慈烺和另两个儿子叫来，简单嘱咐几句，令他们外出逃难。太子朱慈烺趁乱逃出了北京，伪装成道士，活到五十一岁。另外两个儿子不知所终，大概死于乱军之中了。
崇祯皇帝不爱女色，嫔妃不多，这个时候在他身边的，只有周皇后和袁贵妃。崇祯皇帝对周皇后说：“你是国母，理应殉国。”周皇后平静地对崇祯说：“国遭大难，自当死节”，然后从容上吊自杀。
袁贵妃哭拜崇祯皇帝之后，也随即悬梁自尽。不料，绳带断了，袁贵妃堕地昏迷过去。崇祯皇帝拔出剑来，朝她胡乱砍了几剑，但都没有击中要害。袁贵妃后来被人救活了，清政府给予膳养，十年后病逝。袁贵妃真是命大。
崇祯皇帝又把两个女儿叫来，长平公主时年十六岁，昭仁公主只有六岁。长女长平公主已经懂事了，她默默地流泪，一言不发；幼女昭仁公主则死死拽着父亲的衣角，吓得哇哇大哭。
崇祯皇帝泪流满面，悲怆地说：“你们记住，下辈子一定不要生在帝王之家”。
崇祯皇帝狠下心来，闭着眼睛，挥剑向长平公主砍去，不料砍偏了，只砍下了她的一条左臂。长平公主倒在血泊之中，疼得翻滚哀嚎。崇祯皇帝实在不忍心再砍了，回手一剑，剌死了幼女昭仁公主，头也不回地出了皇宫。
长平公主后来也被人救活了，但终因思念父母，抑郁成疾，两年后就去世了。在民间传说和文学作品中，公主被一位尼姑救走，教会她一身绝世武功，被人称为独臂神尼，这属于虚构，不是真的。
崇祯皇帝亲手杀了两个女儿之后，踉踉跄跄地出了皇宫，跑到了皇宫北边的煤山，就是现在的景山，身边只有太监王承恩一个人跟随。
崇祯皇帝走投无路，只好选择自杀。他写下遗书说：“朕因为无德，犯了天怒，降下这场大灾。然而，这都是因为各位大臣误国。朕死后无颜去见祖宗，自己去掉冠帽，用头发盖住脸面。朕的尸体任凭盗贼分裂，但不要伤害百姓。”崇祯皇帝在一棵歪脖子树上上吊自杀，时年三十三岁。太监王承恩陪同一起吊死。
《明史》对崇祯皇帝在国亡之时的表现，写得十分详细，称之为亡国之义烈，读后令人唏嘘不已，感慨万千。
崇祯皇帝在遗书中谴责大臣误国，可是，在他死后，有四十多位大臣自杀殉国，有二百多名宫女和其他宫人投河自尽。京城一片哭嚎，连象房的大象都流泪哀吼。
崇祯皇帝虽然是亡国之君，但后世并不把亡国的责任完全归咎于他，反而对他给予了很多同情。当然，崇祯皇帝对于明朝灭亡，是负有不可推卸责任的。
李自成攻占了北京城，推翻了明朝统治，但战乱仍在继续，天下仍然处于混乱之中。特别是，屯聚在山海关外的清军铁骑，正在虎视眈眈，就要大举入关，准备夺取中原了。