朱元璋怒气冲冲，不分青红皂白，大开杀戒，不少人被灭族，数万人被诛杀。《明史》记载说，朱元璋总共杀掉了三万多人，其中无罪而受株连的，就达两万多人。《明史》对朱元璋的凶残暴行，也是记载无遗的。
开国功臣、韩国公李善长被灭族，李善长和家族七十余人一并处死，李存义自然不能幸免。李善长为明朝建国立有大功，即便他有知情不报之罪，也不应该受到灭族的重刑。因此，李善长得到人们同情，许多人为他喊冤叫屈。
李善长的儿子李祺，是朱元璋的女婿。朱元璋的女儿临安公主苦苦为丈夫求请，朱元璋赦免了李祺的死罪，将他流放到江浦。临安公主重情重义，抛弃荣华富贵，自愿跟随丈夫同行，一块过苦日子去了。
开国时候被封侯的功臣陆仲亨、唐胜宗、费聚、赵庸、胡廷端等九人被杀，加上后来被封侯的，共有二十多位侯爷丧了命。朱元璋剥夺他们的爵位，制作《昭示奸党录》，诏告天下。其实，他们中间，除了陆仲亨、赵庸、费聚等少数人以外，其他人并没有参与胡惟庸的造反阴谋，只是受到了牵连，才蒙冤被杀的。
就连大名鼎鼎的贤臣宋濂，也无故受到此案牵连而死。宋濂的孙子宋慎，卷入胡惟庸案中被杀。当时，宋濂已经年老，辞官还乡，却仍然被牵连，判处死刑。
宋濂当过太子朱标的老师，马皇后和朱标为宋濂求请，马皇后甚至不吃饭，朱元璋这才勉强免去了宋濂的死罪，但仍然将他流放到茂州。宋濂年老体衰，经不起折腾，含冤死于途中。
当初，朱元璋处死胡惟庸，属于胡惟庸咎由自取；后来，朱元璋却大搞株连，滥杀无辜，这就暴露了他凶残的本性。所以说，有人称朱元璋是暴君，并不为过。
在朱元璋时期，除了胡惟庸案，还有一个蓝玉大案，朱元璋做得就更过分了。