(一)阳光消磁清洗法：只要将晶石放于可被阳光直接照射的位置，例如窗台及露台等；照射时间约为30分钟至1小时。注意事项：(1)晶石在阳光照射下会产生聚焦作用，如在晶石附近摆放了纸张或其它可燃烧物品，会有引起火险的危险。（2)但如何晶石的色原素含有铜与铁，便不适用于此类清洗方法，由于此等物质在阳光底下受到长时间照射，会产生氧化作用，因而令到晶石退色。含有铜与铁的色原素包括有红色或紫色等水晶石。
(二)月光星晨照射法：在月光明亮的晚上或者是星光闪闪的晚上，将晶石放在窗边，让其接受月光与星光的照射即可。自然，农历十五月圆之夜或者是十五前后的几天，由于月亮的光芒特别强，晒石的效果也更好。注意：如接受照射的是紫色或红色的晶石，一定要牢记，必须在第二天中午之前将晶石收回，阳光会影响晶石的色素，使晶石褪色。
(三)海盐浸洗法：将晶石放进一杯海盐或粗盐水中，浸泡三至四个小时即可。注意：(1)如晶石是镶嵌在金属物中制成的饰物，则在清洗前要将晶石拆离金属物之后才放进盐水浸泡，否则会影响到金属的色泽与亮度。(2)此类清洗方法可能会使晶石的内含物在清洗后有所改变。
(四)海盐埋藏法：将晶石埋藏于海盐(或粗盐)堆中约数小时即可。注意：同第三条的两点注意事项。
(五)雪堆埋藏法：将晶石埋藏于雪里数小时即可。注意：如晶石体积较大则不适宜使用这种方法。因为将晶石埋藏于雪堆一段时间后再取出时，会因内外温差而产生热胀冷缩，有可能使晶石爆裂。
(六)清水净化法：将晶石放在水龙头下冲洗约二十分钟即可。注意：如属于黄铁矿或蓝铜矿则不适宜使用此方法。因为这些矿石含有铁与铜的成份，不宜用水冲洗。
(七)香熏净化法：在室内点燃香薰料，让晶石接受香熏即可。
（八）晶簇净化法：将晶石放到晶簇上即可。
(九)自然清洗化：只要将水晶放于郊野之地，让大自然来净化晶石即可。
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