还有立法机关，是共和国中最要的根本，从前由代表会组织参议院，是创始的暂行规模，现在国家统一，应该由参议院改为国会。《临时约法》中第53条，有限10个月内，召集国会的明文，袁不能违背，参议院也不能缓议，因此逐日开会，议决《国会组织法》，及《参议员众议员选举法》。国会组织法共22条，大要用两院制，便是参议院及众议院。参议院议员，由各省省议会选出，每省10名。蒙古选举会，得选出27名，西藏选举会，得选出10名，青海选出3名，中央学会，得选出8名，华侨得选出6名，共294人。众议院议员，由各地人民选举，每人口满80万，得选一议员，人口多寡不等，拟定直隶省46名，奉天省16名，吉林省10名，黑龙江省10名，江苏省40名，安徽省29名，江西省35名，浙江省38名，福建省24名，湖北省26名，湖南省27名，山东省33名，河南省32名，山西省24名，陕西省21名，甘肃省14名，新疆省14名，四川省35名，广东省30名，广西省19名，云南省22名，贵州省13名，蒙古27名，西藏10名，青海3名，共595人。参议员任期六年，每二年改选三分之一，众议员任期三年。两院议员的职权，（一）是建议，（二）是质问，（三）是查办官吏纳贿违法的请求，（四）是政府咨询的答复，（五）是人民请愿的受理，（六）是议员逮捕的许可，（七）是院内法规的制定。至若预算决算，及议定宪法权由两院合办。两院议员，须各有过半数出席，方得开议，议案须得过半数同意，方得决定，可否同数，由议长取决。每年会期四个月。
临时参议院结束前，正式国会先选举参众两院议员。民国元年12月中旬开始参众两院的初选，经过两个月时间选举宣告完成。当时民主选举还在草创阶段，一切进行都很生涩，几乎是一边争吵，一边进行，因为一切既没有成规，而宪法还在争论。
宋教仁在国会选举期间表现得最活跃。这个时候孙中山已东渡日本，国民党党务由宋教仁代理理事长，他由北京前往南京、上海、湖北、湖南各省，到处公开讲演，抨击时政，指责袁，是一个不符民意的、退步的政府。他真是一个民主政治的天才，能说会讲，下笔千言，倚马可待。他有一种魔力，任何一种群众场合，只要他一出现就能使整个场面在他控制之下，他的活力、天赋和讨人欢喜的丰彩，很像遇刺的美国总统肯尼迪。他们都是属于“彗星”这一类型的政治明星，在天空放出异彩，可是闪亮得快，消失得也快，在世界上只是昙花一现。
中华民国首届国会的选举，由于宋教仁的主持有功，选举结果国民党大获全胜，下面是参众两院各党得票的详细数字：
在众议院，众议员共596人，各党得票如下：
国民党得269议席，共和党120议席，统一党得18议席，民主党得16议席，跨党者得147议席，无所属的26席。
在参议院，参议员274人，各党得票如下：
国民党得123席，共和党得55席，统一党得6席，民主党得8席，跨党者38席，无所属的44席。
照上面数字，国民党在参众两院870议席中，共占了392席，共和、民主、统一三党加起来在两院中也只223席，也就是说国民党有绝对票数可以影响参、众两院。
袁世凯在国会选举后，才知道民主政治的特性，是一切决定于选民，国民党大胜后，他忧心忡忡，悄悄告诉杨度说：“我不怕国民党用暴力来夺取政权，我只怕他们以合法手段赢得政权！”