如果从整个地球生物界来考虑，动物的进化虽然在体形上会有很大的不同，但在功能和特点上却是应该有同步进化的特点，看一看我们周围的动物吧！哺乳类动物中有许多特点和功能是相同的，从中可以看出它们是沿着一条本质相同的轨迹在进化。而我们人类却是整个动物界的奇迹，我们进化的轨迹与它们根本不同，简直就是两回事，除了人以外，我们再也找不着直立行走的动物。如果说直立行走标志着动物的进化，那么这种进化就不应该单单反映在人类身上，而在其他动物之间也应该有类似的进化发生，这才符合整个地球动物进化的规律。然而在其他动物中，我们看不到一点点直立行走的趋向，这是为什么呢？如此追问下去，我们人类的进化谱系究竟是怎么来的呢？
我们生活在地球，对地球自然界生物的进化是有相当直观的认识，进化是为了更好的生存，而自然界里更好生存的前提条件是什么呢？跑得快，使你可以有更多机会捕捉到食物，逃避攻击；身子灵巧，可以使你巧妙逃避天敌的进攻；目光敏锐，可以更早发现食物或前来进攻的对手；力气大，可以轻易打败对手，保护自己；爪牙锋利，可以具备极其有效的进攻武器。可我们人类是向这些条件进化的吗？不，不是。进化没有给我们飞快的速度、灵巧的身躯、鹰一般的目光、牛一般的力气、猛虎一样的利爪，我们什么都没有。那么，自然界为什么要如此进化人类呢？这种进化有什么合理性呢？一点都看不出来，可以说，我们人类自从产生以来，就与这个自然社会格格不人，要么我们是错误的，要么自然界是错误的。
时至今日，许多人依然认为，人类的进化是源于自然的压力，这些压力包括洋流、冰川、地轴倾角、气候、生物变化等等。但是人类自从诞生以来就生活在地球上，与地球上许许多多动物同样经历着来自大自然的各种压力，由于这种压力是共同的，因此由压力引起的变异也应该具有趋同性。可人类的进化道路恰恰与其他动物没有丝毫的相同之处，这又是为什么呢？
如果谈到人类与其他动物的智力问题，达尔文的进化论更是左右碰壁，而智力问题又是人与动物区别的根本所在，没有人能够回避得了。
人类的智力来得莫名其妙。智力的发展应该有两个条件：第一是相对艰苦的生活环境，为了生存就需要用更多的智力去获取食物；第二是动物的群居性，群居的动物可以形成一定的社会模式，要求以更高的智力来处理。这两个条件都符合我们人类，我们曾经有过相对艰苦的生活环境，我们也是群居动物。但问题在于，这个理论根本没有普遍性，对许多动物而言，目前的生活环境比以往任何时候都要艰苦，人类的捕杀与环境污染就使许多动物快要绝种了，地球上群居动物决不仅仅是人类，连蚂蚁都是群居动物。在这两个条件符合的情况下，其他动物的智力发展水平如何？这是一个不需要回答的问题。
人种问题也是进化论不好解释的谜案。现在世界上基本有黄、白、黑、棕色四大人种，这四种人分布在世界各地，就其居住地区来说，黄种人基本在亚洲，白种人基本在欧洲，黑种人基本在非洲，而棕色人种则在澳洲，美洲的印第安人大至属于黄种人系，即蒙古人种。这四色人种的区别不仅仅在肤色上，而且在生理结构方面也有细微的差别。比如说，黑种人血液当中所含红血球就与黄种人不同，它能输送更多的氧气，因而黑种人在运动方面有得天独厚的条件；黄种人的味觉系统是全世界最发达的，因此中国菜也是五味俱全，花样繁多；而白种人的味觉系统则十分迟钝，只好在吃的方面简单一些了，等等。
如果进化论是正确的，那么这四个人种应该是由四种猿演变而来。然而，进化论又断言，从猿进化到人是自然界中的偶然现象，地球上只有一支猿类进化成了人，所以它不可能普遍适应灵长类的进化模式。这本身不是很矛盾吗？既然已经有一支猿类进化成了人，那么其他猿类为什么不可以进化成人呢？既然只有一支猿类可以进化成人，那么四色人种又是怎么来的呢？如果说有四支不同颜色的猿遗传进化成了四色人种，这本身是违背进化论的，而且我们也找不到地球上曾经存在过黄猿、白猿、黑猿、棕色猿的证据。
如果说四色人种的确是由一支猿进化、变异而来，那么这种变异与自然生存又有什么关系呢？大家知道，依据进化论的观点，生物的变异只是为了更好地适应自然环境，而且惟有适于生存的变异才可以保留下来。那么这支进化中的猿为什么要发生如此变异呢？非洲基本在赤道两侧，乃属于热带地区，如果非洲黑猿要发生变异的话，也应该变异成白人，这样可以反射一些太阳的光线，在物理学上也说得过去，可是非洲人种恰恰是黑色的，这如何解释呢？问题还有，如果说非洲人是黑色的就是符合自然规律，那么美洲印第安人呢？他们一样生活在赤道附近，所接受的紫外线与非洲人一样多，为什么他们不是黑色的呢？再说白种人，现在白种人的老家欧洲，基本在北纬30°以北，已经过了北回归线，像欧洲北部的一些国家，生活的纬度都很高，黑色皮肤不是更可以吸热保温吗？可他们恰恰都是白色的，像冰雪般的颜色，这又是为什么呢？
人种问题不解决，进化论就不可能最后深得人心，就会有更多的人起来反对它。而到目前，还没有一种关于人种问题的解释让人看起来有些道理，难怪日本东京大学的养老孟司教授说：“关于人种的差异，至少可以指出这样或那样的不同，至于为什么同，回答是完全不清楚的。”
近百年来，人们在全世界各地陆陆续续发现了一些十分稀有的人种，而这些人种的存在，本身就是对达尔文人类起源于古猿的批判。
1996年5月7日，《北京晚报》援引了新华社和国际电台的报道：美国科学家在南极洲发现2亿年前的人形化石。无独有偶，法国巴黎大学植物学教授拉坦博士在非洲扎伊尔的原始森林中，发现了一个奇特的人种部落，他们的椎骨都突出体外，有的达几公分，与我们熟知的食肉恐龙的脊椎骨很相似，被称为“恐龙人”。拉坦博士推测，这些人“似乎是从史前爬行动物直接演化而来的”。但她不愿意透露该部落的准确方位，只是说在扎伊尔著名的斯蒂恩莱瀑布西南约480公里的密林中。这些恐龙人的祖先是谁？恐怕不会是猿类吧！因为地球上还没有发现背上长角的猿类。
1958年，美国国家海洋学会的罗坦博士，在大西洋3英里深的海底，拍摄到了一些类似人的奇妙足迹。1968年，美国迈阿密城的水下摄影师穆尼，在海底看见过一个奇怪的生物，脸像猴子，脖子比人长四倍，眼睛像人但要大得多。本世纪30年代，美国南卡来罗纳州比维市郊的沼泽地区，多次发现过“晰蝎人”，它们高达2米，长着一条大尾巴，每只手仅有三根手指，可以直立行走，力气惊人，；能轻易掀翻汽车。这些生活在水中、沼泽中的类人生物，其祖先又是谁呢？
美国加利福尼亚大学工学院的生理学家韦西在智利安第斯山脉探险时，曾在澳坎基尔查峰海拔6600米处发现了蓝色皮肤的人种。不但在南美洲，人们在喜马拉雅山也曾发现过蓝色皮肤的人种，在非洲的西部地区也有发现。如果按人种来说的话，这是一个全新的人种。
由于达尔文的人类起源学说不能尽善尽美，不能解释人们心中的疑问，因而这套学说遭到世界上许多人的怀疑，尤其是近十几年来，来自科学界的批判就有很多，反达尔文者找到了越来越多的证据，包括化石、人种、自然环境、基因等证据。近些年来，世界范围内人类起源的讨论又逐渐火热起来，人们从不同的角度对人类的起源提出了新的假说。
人类起源于外星人的假设，是近几年来西方最新的一种假设，它是由西方科学家马蒂斯提出来的，其根据是在圣地亚哥发现的一个头骨化石。他研究了这个头盖骨后认为，这具头盖骨所代表的人种，其智力要远远高于我们今天的人类，从而推测这是一个外星人的遗骨，进而提出人类祖先是外星人的假说。他是这样来描绘这一假设的：大约在5万年前，从宇宙的深处来了一群外星人，他们具有高度的智慧。当他们发现地球引力环境不适合他们居住时，他们就选择了地球智力较高的雌猿进行杂交，生产下的后代就是人类，因此，外星人是人类的祖先。
还有一些科学家，根据人类体表特征与海洋生物十分接近的证据，提出人类起源于海洋生物的假说。
近一两年来，还有人主张“大四季”说，他们根据太阳系不停围绕银河运动的事实，假设太阳系围绕银河中心旋转与地球围绕太阳旋转一样会出现四季变化，称为“大四季”。人类在大四季交换中，根据自然环境的变化，不断改变生存的方式，比如，当夏季来临时，地球就变成了一颗纯水的星球，人类为适应这种变化，慢慢由陆生动物转变为水生动物，这就是人体体表具有海洋生物特征的原因；当夏季结束，秋季来临的时候，地球的水渐渐退去，人类又从海洋生物转变为陆地生物。这是一个很具想象力的假设。
无论哪一种关于人类起源的假说，都有致命的弱点，基本不能自圆其说。这样一来，人类起源之谜，真正成了千古不破的谜团。几千年来人们不断地问：我们究竟是从哪里来的呢？
不难看出，现代人类起源的各种假设，从思维上可以分为两大类：一类将人类起源的原因归结为地球以外的偶然，即人类不是地球生物自身演变的结果，而是由宇宙深处来的高智慧生物创造的，像外星人创造人类说；一类则坚持认为人类的起源只能从地球自身的发展来考虑，不论怎么变化，人类总是地球生物自身进化的结果，像生物进化论。这两种思维互有道理，又互有弱点。平心而论，人类起源于地球生物自身演变的学说更加占有证据（且不论这种证据是否充分），这也难怪，毕竟生物进化论已经发展了100多年，而其他假设只能在夹缝中挣扎，根本没有形成一股参与的势力。
但是，从历史上而言，人类起源于地球以外的偶然因素的观点更加古老。早在人类的初期，即6000年以前，我们的祖先就在思索起源的问题，并提出了一个全世界性的假设，那就是，人类是由万能的神、万能的上帝创造的。这个假设，在本质上与外星人创造人类说法相同。由此可见，人类思维的发展是有很大局限性的，它的历史延续性是不可忽视的。
然而，上帝创造人的观点，却被现代科学彻底批判了，因为它是宗教的，因为它是唯心的。正统思想认为，神是原始人凭空想象出来的，既然没有神，那么神造人的说法当然是无稽之谈。
几乎世界所有民族的史前“创世纪”神话篇章中，在解释人类起源时，都说是神创造了人，基督教说是上帝创造了人类，中国神话说是女娲或黄帝创造了人类……那么，就有一个纯技术性的问题：人是可以被制造的吗？
创造与发明是现代人的拿手好戏，从60万年以前（关于石器时代开始的时间，学者们多有争论，二三百万年说证据不足，我认为应坚持60万年说），人类发明第一块石器开始，人类就走上了制造业的道路，我们的文明就是以制造业为基础的。随着科学的进一步发展，人类制造的本领越来越高，我们不但可以制造那些没有生命的东西，像一张床，一部电话机，一台机器，一辆汽车等，我们还可以在生命的基础上再造新的生命。