此时，丞相刘屈氂已经从刚开始的慌乱中稳定下来，派丞相府的长史前来禀报情况。武帝问：“丞相有何举动？”长史答：“丞相因事牵皇室内部，正努力封锁消息，未敢轻举妄动。”武帝怒道：“现在人言藉藉，无人不晓，情况危急，哪里还有什么秘密可言？丞相怕杀了皇子大逆不道，难道他不知道周公也曾把管叔、蔡叔诛杀了么？”当即赐刘屈氂玺书，交长史带回，同时转告丞相：“尽全力捕杀谋反者，朕自有赏赐。一定要用牛车结阵，不要短兵相接，多用弓矢毙敌。同时要坚闭城门，不要让造反的人逃脱。”为了更好地指挥平叛，武帝从甘泉宫搬到建章宫居住。
丞相刘屈氂刚开始时闻变出逃，丢了印绶，此时接到武帝玺书，让他征召三辅临近各县的将士和各地两千石以下的官员###太子。太子在宫中见丞相刘屈氂调兵遣将，军队调动集结的报告不时传来，自己仅凭宫中护卫抵抗，兵力悬殊，形势紧急，要么束手待毙，要么铤而走险。太子最终选择了后者，他决定与父亲和那些奸佞小人作一次抵抗。
当时，长安城内的大部分军队仍由丞相掌控，太子的兵很少。他可能调动掌握的军队主要有三支：驻扎在长水、宣曲的两支胡人部队和驻扎在城北的护北军。太子派门客如侯持赤色节杖前去长水校尉、宣曲营地调拨骑兵。孰料还是晚了一步。武帝知道太子可能盗用皇帝节杖调派军队，就急令在原来赤色的节杖上加上黄色的旌缨以示区别，并派亲侍四出火速传达给驻扎守军。等太子派的如侯持原来的赤节来到的时候，武帝派的侍郎马通已经到达。马通就和胡兵将如侯斩首，将这两支部队调拨去支援丞相。
太子此时还不知情，亲自持节来找北军的护军使者任安，恳求任安发北军去助战，消灭蒙蔽皇上的奸佞。任安的士兵将太子很有礼貌地拦在城外，任安亲自出城接见，太子拿出赤节让其出兵。任安内心矛盾重重，思索良久，最终还是跪拜接受了符节。等返回军营，他却闭门不出，拒不发兵。
太子没有调动一支正规部队，只得把关押在城内的囚徒全部放出，发给他们兵器，由少傅石德和门客张光统率，鼓动他们共击奸贼，必定按功封赏。不过，这些乌合之众在丞相率领的正规军的打击下，迅速土崩瓦解了。
长安城内一片混乱。当时大部分人不清楚事件的真相。有人说太子谋反，有人说武帝暴亡，奸臣夺位，太子自卫，一时不知道支持哪一派，只得四处逃散。太子见囚徒兵寡不敌众，危在旦夕，只得将长安城内的平民百姓驱赶数万出来，充当士卒，做拼死抵抗的准备。
太子的军队和丞相的军队进行了五天五夜的恶战，繁华的长安城每一条街巷都成了杀戮战场，喊杀声惊天动地，成片的百姓倒下，尸体层层叠叠，鲜血汇成了小溪，汩汩流淌，真正达到了流血漂橹的地步。五天五夜的血战后，太子的兵卒毕竟没有经过严格训练，在训练有素的正规军面前毫无还手之力，几乎全军覆没。丞相的军队逐渐控制了长安的局势。
太子见大势已去，只得趁夜带领两个儿子和几个亲兵准备从城南的覆盎门逃跑。此时守卫覆盎门的司直田仁，早已按照武帝诏令紧闭城门，重兵把守。太子来到城下，见城头上士兵林立，慨叹“今朝休矣！”司直田仁有恻隐之心，就打开城门，放太子一行出城。太子感激地盯着田仁，田仁脸色冷峻，一言不发，目送太子出城。丞相刘屈氂领兵追到，得知田仁擅自放走太子，准备将其就地正法。随军的御史大夫暴胜之阻拦说：“司直身为朝廷的二千石大员，理应先行奏请，怎能擅自处斩呢？”丞相无言以对，只得暂将田仁投入牢狱。武帝得知后大发雷霆，派内侍质问暴胜之：“司直擅放逆子，丞相杀他是执行律令，你为何袒护他？”暴胜之惶恐不安，自尽身亡。田仁则被腰斩。
对接受太子符节的任安，尽管其没有发兵帮助太子，武帝认为他首鼠两端，坐观父子相斗，是怀有二心，两面讨好，就将任安腰斩了。
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巫蛊案四（3）
武帝处罚了一些人，对那些立下大功的人也不吝赏赐：封斩杀如侯的马通为重合侯，抓获少傅石德的景建为德侯，捕捉张光的大鸿胪商丘成为秺侯