大骚乱中，创造省成为受影响最小的地方。一万名科学近卫军，两万名武装工人，十万名治安队员日夜守护要害，维持各地治安。仅仅二十年前，布莱尼凯姆市民还在围观魔媒遭受自然回归大刑。今天，“不能让邪教再回来！”已经成为当地人的共识。
飞鱼帮仍旧祭祀飞鱼神，但是在骚乱中，奥伊娜毫不犹豫站在丈夫一边，她的帮会也把吴昌文看成了新把头。一年来，六成帮众进入码头当上工人，生活稳定安逸。“科学力量”号项目启动后，帮会会员成了建造船坞的主力，工资不断提高。创造省势力排在前面的几大帮会，都成为治安队的主力。
旋风派嫡系乌颜潜入创造省，联系旧稽察队员，组织对造船厂发动袭击，成功地放火焚烧木料。然而旧官员中也有人想保全家庭，避免成为双方斗争的炮灰，便向吴昌文密报。情报局将乌颜等人包围，老牌稽察队长知道无法突围，服毒自杀，成为护教大起义中真理教损失的在任最高官员。
大混乱中，光明神教徒也给科学大会意外的助力。现在，共和国境内已经有一万多名在册的光明神教徒，很多人都在赫瓦贾召唤下冒死偷渡，“去有灯光的地方工作”。他们大多识字，可以在科学工厂做工。虽然不能持有武器，但是光明教徒拿着平衡棒日夜巡逻。发生骚乱时，他们会挺身而出保卫新工厂，前后共有一百多名光明教徒死于冲突。
不是正规战争，更没有战俘保护条例，遇到敌人间谍，查清案情后就由省长下令处决。即使法利哈这样年轻温柔的女省长，也签发过几十道死刑令。骚乱后统计表明，科学大会共处决2625名真理教支持者。
骚乱中，遥远的马达加斯达岛才算世外桃园。由于克里木丧尽人心，当地人把科学大会视为救星，无论是否情愿，纷纷在饥饿中签下卖身契。饥荒过后，近卫军已经建立起完整的新秩序，不用再花精力打散当地的旧势力。另外，毒丸计划也无法在这里实施，马塞尔早就封锁全岛，任何海上偷渡都不可能。
护教大起义越演越烈时，马塞尔还给本土提供了巨大帮助，一口气派回整整三万名宣誓忠于科学的工人！他们像军队一样由老区工人带领，分派到各个工程项目中去，真理教间谍对他们完全无法渗透。
骚乱规模越大，会员的战斗意志越强烈。朴运成已经不在，他的精神之火反而越烧越旺。他们就是要砸烂旧世界，创造新世界，就是要消灭挡在这条道路上的任何人。
到科学纪元十五年6月，尽管受到巨大挫折，大会会员反而激增到十二万人，以1300：1的比例控制一亿四千万人口。速射枪超过两千挺，子弹四千万发，还有五百门陆战炮随时能投入前线作战。进步城船厂又送出四艘七千吨级大船，分别命名为“松本聪香号”、“吴兴川号”、“马伦巴号”和“普拉卡什号”。曙光城新船厂第一艘万吨轮顺利下海，定名为“朴运成号”，在“科学力量号”下水前，暂时担任科学海军旗舰。
加上这些新生力量，科学海军拥有六十艘铁壳船，二百艘海洋快舟，总吨位超过二十八万吨。除此之外，民间公司拥有的机械船也有十万吨位，随时可以应征入伍。
首台内燃机样机持续工作一千小时后报废，已经具备实用价值。米纳斯油田钻过十二口废井之后，石油终于冒出地面。科学大会已经带着人类走回二十世纪的门坎。
夹在两大势力中间，普通百姓也越来越愿意接受大会作庇护者。他们减免掉七成农业税，这对于大会不算什么，当地很多人却因此有了救命口粮。大会工厂无限量收购棉花和羊毛，让很多农民增加了收入。由于不再有饮食禁忌，上百万人接受以工代赈，在全境大修公路，农产品通过这些新路运向四面八方。
在这个九成人民还不识字的环境里，富裕是最简单的执政基础。骚乱最后阶段，普通百姓开始主动检举真理教间谍，外来力量失去了群众基础。
科学纪元15年5月20日，苏吉拉纳宣布结束紧急状态，让社会和国家都恢复正常运转。
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