至此，无数大臣被斥被贬被杖打，明神宗身心交瘁、郑贵妃悒郁不乐、整个帝国不得安宁的“国本之争”，才算告一段落。争国本的官僚多是后来的东林党人，因此它又是东林党争的一项内容。国本之争，使得明神宗悲痛欲绝，他感到自己虽贵为天子，而终被群臣所制，最终和大臣闹掰，逐步对朝政失去兴趣，开始怠政，直到驾崩。
后世有学者认为，明朝的衰败其实就是从万历十五开始的，也就是国本之争开始的，这种说法也不无道理。
朱由榔对此自是非常了解，当然，他也有自己的看法。
在他看来，明面上，明朝的衰败的确是从国本之争开始，但根子里却是万历帝挑战封建礼教的失败。
朱由榔要推行新政，必然会对封建礼教发起挑战，事实上，他已经在做了，比如新政的推行，比如他纳戴忆兰为妃，比如他提出的“以民为本”的治国方略，无一不是对旧有观念和封建礼教的挑战，更何况，他还要推行妇女的解放，禁止人口买卖等。
当然，他也明白，要挑战千百年来形成的这种观念禁锢，绝对不是件容易的事情，必须慢慢来，找准机会，抓住突破口。
……
“令斌，你糊涂啊，当年的国本之争是有争者，如今只有煊儿一个皇子，何来国本之争？勿复多言，朕有数，不会重蹈神宗覆辙的。”朱由榔摆了摆手，不叫他再说下去。
“这……”陈邦彦嗫嚅两声，没再多说，退回班中。其他人也互相看了看，没有说话，但心里都在打着小九九。
“陛下，广宁一案对臣触动甚大。都察院负责监察百官之责，却始终因循旧制，人浮于事，作作表面文章，未能沉到下边体察民情，此臣之失职。臣自回广州之后，一直在想陛下之教导，痛定思痛，臣拟了份条陈，请陛下御览。”
黄宗羲见大家不再说话，出班奏道，末了从袖子里拿出一份奏折。
“呈上来。”朱由榔命道。
李洪从黄宗羲手里接过奏折，交给朱由榔。
朱由榔展开一看，略过一些虚话，他的改革措施是两条。
一是府州县设立监察机构。各省都设有按察使司衙门，是明面上的监察机构，代表官方发声。但这个机构只有省一级有，监察的触角很难延伸到州县一级。黄宗羲之所以建议在府州县也设立监察机构，就是想把监察的触角下探。
二是建立暗访制度，都察院派员对各省治政、官声进行暗访，每年每省至少暗访一次。
朱由榔看完，想了想后世有效的监察制度，说道：“这两条朕以为可以施行。不过，府州县的监察机构应由省都察院统辖，不与平级官府发生上下级关系。另外，朕意再加一条，建立明察制度，与暗访制度互相衬托。明察则是大张旗鼓地听取民意，发动百姓申冤诉苦。还有就是，暗访的关键是暗，也就是保密，决不能这里还没有出发，那边早就知道了，做好准备了，如果这样，暗访就没有意义了。你好好琢磨，在‘暗’字上下下功夫。”
“陛下圣虑深远，臣真是佩服得五体投地。”黄宗羲听完，连忙拍马屁。
也不知道他是真服还是假服。